2025年string蛋白互作（2025年string蛋白网络互作图）

STRING科普贴:蛋白互作网络构建

STRING数据库是一个功能强大、易于使用的蛋白质互作网络构建工具。它提供了丰富的蛋白质互作信息，支持用户进行多种形式的搜索、查看、导出和分析。通过STRING数据库，用户可以深入了解蛋白质之间的相互作用关系，为生物学研究和药物开发提供有力支持。

STRING数据库（string-db.org/）是一个搜寻蛋白质之间相互作用的数据库，提供实验数据、文本挖掘结果、综合其他数据库数据以及生物信息学预测结果。目前更新到Version 10b，应用范围覆盖2090个物种，包含24，584，628种蛋白和3，123，056，667个蛋白质之间的相互作用。数据库更新中，继续增长。

实用工具丨基于STRING的蛋白质相互作用(PPI)分析

基于STRING的蛋白质相互作用（PPI）分析 STRING（Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins）是一个在线的生物信息学数据库，它整合了多种数据来源，包括实验室实验、文献报道和计算预测，旨在提供全面的基因和蛋白质相互作用信息。

STRING（functional protein association networks）是一个用于探索蛋白质之间相互作用的数据库和工具，而Cytoscape则是一个用于可视化、分析和集成分子相互作用网络的强大软件平台。

访问STRING数据库打开STRING数据库官网：https：//string-db.org/。该数据库整合了实验验证、文献挖掘、基因共表达及计算预测等多种数据来源，支持多种物种的蛋白质相互作用查询。 输入查询蛋白单蛋白查询：在搜索框中输入目标蛋白名称（如人类中的TP53）或UniProt ID，选择对应物种后提交。

通过以上步骤，我们可以使用String数据库和Cytoscape软件构建并分析PPI网络，从而揭示蛋白质之间的相互作用关系，为生物医学研究提供有力支持。

STRING数据库是一个综合性的蛋白质相互作用网络数据库，整合了多个公共数据库，如UniProt、KEGG、NCBI和Gene Ontology，构建了一个全面的蛋白质相互作用网络。数据库提供网络可视化、蛋白质家族、途径和亚细胞定位信息，并配备分析工具，如聚类分析和GO富集分析，以辅助用户深入分析网络。

STRING网站提供蛋白质互作网络图制作服务，适合输入多个蛋白进行分析。首先，输入基因列表并选择对应物种后，点击搜索按钮。对于大量差异基因表，网络复杂度高，建议调整参数以优化结果。通常，调整最小所需交互分数至highconfidence或highestconfidence，并隐藏不连接的节点。选择更新后生成符合需求的网络图。

STRING数据库-蛋白相互作用网络分析

STRING数据库-蛋白相互作用网络分析 STRING（Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins）是一个用于检索和分析蛋白质相互作用的在线数据库。

STRING（Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins）是一个用于分析已知或预测的物种蛋白质互作关系的在线网站。该数据库涵盖了5090种生物的两千四百多万种蛋白质（24584628），是目前很多蛋白质互作数据库中覆盖物种最多、互作信息最大的一个。

访问STRING数据库打开STRING数据库官网：https：//string-db.org/。该数据库整合了实验验证、文献挖掘、基因共表达及计算预测等多种数据来源，支持多种物种的蛋白质相互作用查询。 输入查询蛋白单蛋白查询：在搜索框中输入目标蛋白名称（如人类中的TP53）或UniProt ID，选择对应物种后提交。

在Cytoscape主界面的file – import - Network from files中导入从STRING下载的蛋白互作网络文件。导入后，蛋白互作网络将出现在软件界面的右上角。导入其他相关定性定量数据 在file – import - Table from files中导入蛋白定性定量数据（如差异倍数和p值）。

蛋白互作网络分析（PPI）蛋白互作网络分析（PPI）是生物学研究中了解蛋白质功能及其相互关系的重要手段。以下将详细介绍如何使用string在线数据库和cytoscape软件进行PPI分析。string数据库的使用 STRING数据库是一个广泛使用的蛋白质互作数据库，它提供了丰富的蛋白质互作信息。

STRING网站+Cytoscape软件制作精美蛋白互作网络图(PPI)

使用STRING网站和Cytoscape软件制作精美蛋白互作网络图的步骤如下：STRING网站操作：登录STRING官网：访问stringdb.org，界面直观易用。输入蛋白信息：在左侧选择输入选项，通常选择“Multiple proteins”以处理多个蛋白数据。在蛋白输入框中输入基因名，并指定物种为“Homo sapiens”。

在生物信息学研究中，STRING网站和Cytoscape软件是构建精美蛋白互作网络图（PPI）的强大组合。首先，登录STRING官网（string-db.org），界面直观易用，左侧列出了输入选项，右侧是蛋白输入框，通常选择“Multiple proteins”处理多个蛋白数据。

Cytoscape是一款功能强大的网络图绘制软件，支持多种格式导入。导入tsv文件后，获得初步网络图，可能复杂且丑陋。Cytoscape的NetworkAnalyzer插件可对网络进行美化。在CytoscapeV7版本中，通过Tools- NetworkAnalyzer-Network Analysis-Generate style from statistics快速美化网络。

使用STRING网站生成PPI图 访问STRING网站 打开浏览器，访问STRING网站的官网：https：//string-db.org/。选择输入方式 在网站左侧一栏选择输入方式为“Multiple proteins”，即多个蛋白的输入。输入差异基因 在蛋白输入框中，输入一列差异基因。