2025年string数据库是干什么的（2025年数据库string类型）

STRING数据库-蛋白相互作用网络分析

1、STRING数据库-蛋白相互作用网络分析 STRING（Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins）是一个用于检索和分析蛋白质相互作用的在线数据库。

2、STRING（Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins）是一个用于分析已知或预测的物种蛋白质互作关系的在线网站。该数据库涵盖了5090种生物的两千四百多万种蛋白质（24584628），是目前很多蛋白质互作数据库中覆盖物种最多、互作信息最大的一个。

3、访问STRING数据库打开STRING数据库官网：https：//string-db.org/。该数据库整合了实验验证、文献挖掘、基因共表达及计算预测等多种数据来源，支持多种物种的蛋白质相互作用查询。 输入查询蛋白单蛋白查询：在搜索框中输入目标蛋白名称（如人类中的TP53）或UniProt ID，选择对应物种后提交。

4、在Cytoscape主界面的file – import - Network from files中导入从STRING下载的蛋白互作网络文件。导入后，蛋白互作网络将出现在软件界面的右上角。导入其他相关定性定量数据 在file – import - Table from files中导入蛋白定性定量数据（如差异倍数和p值）。

5、蛋白互作网络分析（PPI）蛋白互作网络分析（PPI）是生物学研究中了解蛋白质功能及其相互关系的重要手段。以下将详细介绍如何使用string在线数据库和cytoscape软件进行PPI分析。string数据库的使用 STRING数据库是一个广泛使用的蛋白质互作数据库，它提供了丰富的蛋白质互作信息。

6、用户可以通过STRING数据库的官方网站（https：//string-db.org/）访问该数据库。使用搜索工具输入感兴趣的蛋白质或者基因的名字，将会得到与查询结果相关的蛋白质相互作用网络和其他相关信息。用户也可以上传自己的数据集进行网络分析。可以利用蛋白的名称、序列等多种格式进行检索，输入基因symbol也是可以的。

String/GeneMANIA两种常用蛋白质网络预测工具数据库简单介绍及操作流程...

STRING是一个广泛使用的数据库和资源，主要用于预测和可视化蛋白质-蛋白质相互作用网络。它结合了实验数据、计算预测以及已知的生物学知识来预测蛋白质相互作用。数据来源 实验验证的相互作用计算预测的相互作用文献挖掘来自其他数据库的信息功能 提供蛋白质之间的直接（物理）和间接（功能）相互作用信息。

官方网站：https：//string-db.org/功能介绍：STRING是一个蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）数据库，它提供了实验数据、预测的相互作用和文本挖掘结果的综合分析。用户可以通过STRING的可视化界面直观地分析蛋白质的相互作用网络，这对于研究蛋白质功能、基因关联和信号传导路径具有重要意义。

STRING数据库：蛋白质相互作用关系数据，一次可检索多个基因，结果可信度较高。GENEMANIA数据库：蛋白质相互作用关系数据，一次可检索一个或多个基因，包含实验验证和基因共表达数据预测结果。IntAct数据库：蛋白质相互作用关系数据，一次可检索多个基因，整合多个数据库，但可信度有所降低。

string数据库该怎么使用

1、访问STRING数据库打开STRING数据库官网：https：//string-db.org/。该数据库整合了实验验证、文献挖掘、基因共表达及计算预测等多种数据来源，支持多种物种的蛋白质相互作用查询。 输入查询蛋白单蛋白查询：在搜索框中输入目标蛋白名称（如人类中的TP53）或UniProt ID，选择对应物种后提交。

2、了解string数据库基础 在使用string数据库之前，首先要了解它的基本结构和特性。string数据库专门用于存储和管理字符串类型数据，它提供了多种字符串处理功能，如模糊匹配、正则表达式匹配等，能够满足各种复杂的字符串查询需求。

3、点击“as short tabular text output” download下载可以在Excel中打开的格式文件，该文件也可以导入Cytoscape等软件进行进一步的网络图绘制和分析。导出蛋白质注释文件：点击“protein annotations” download下载蛋白质注释文件，该文件包含网络中每个蛋白质的详细注释信息。

4、数据库概况 收录范围：目前，STRING数据库已收录12535个物种，包含53 million个蛋白和超过20 billion种互作关系。官方网站：https：//cn.string-db.org/搜索功能 搜索界面：进入STRING官网后，点击“SEARCH”按钮即可跳转至搜索界面。

5、在STRING数据库的首页，用户可以输入一个或多个基因或蛋白质的名称。对于多条序列输入，需要使用fasta格式，并以“”号开头。输入完成后，点击“Search”按钮进行检索。选择目标蛋白质 检索完成后，会跳转到基因与蛋白质对应的界面。由于一个基因可能对应多个蛋白质，用户需要选择自己感兴趣的目标蛋白质。

6、如何使用STRING数据库构建蛋白互作网络 访问数据库：通过浏览器进入STRING数据库官网。搜索蛋白：在搜索页面，用户可以通过输入单个或多个蛋白的名称、氨基酸序列来查找互作网络。对于单个蛋白搜索，选择“Protein by name”；对于多蛋白搜索，选择“Multiple proteins”。

STRING科普贴:蛋白互作网络构建

STRING数据库是一个功能强大、易于使用的蛋白质互作网络构建工具。它提供了丰富的蛋白质互作信息，支持用户进行多种形式的搜索、查看、导出和分析。通过STRING数据库，用户可以深入了解蛋白质之间的相互作用关系，为生物学研究和药物开发提供有力支持。

STRING数据库（string-db.org/）是一个搜寻蛋白质之间相互作用的数据库，提供实验数据、文本挖掘结果、综合其他数据库数据以及生物信息学预测结果。目前更新到Version 10b，应用范围覆盖2090个物种，包含24，584，628种蛋白和3，123，056，667个蛋白质之间的相互作用。数据库更新中，继续增长。